本周《自然-通訊》發(fā)表的兩項獨立研究RAS-pathway mutation patterns define epigenetic subclasses in juvenile myelomonocytic leukemia和Genome-wide DNA methylation is predictive of outcome in juvenile myelomonocytic leukemia鑒定出了幼年型粒-單核細胞白血病(JMML)的三種新亞組,它們可以預(yù)測病人結(jié)局,包括最有可能發(fā)生疾病自行消退的病人。
無監(jiān)督聚類分析揭示了JMML病人三個明顯的DNA甲基化亞組。
Stieglitz et al.
幼年型粒-單核細胞白血病(JMML)是一種惡性兒童癌癥,治療手段有限。目前的JMML臨床和遺傳標(biāo)記沒有解釋與該疾病相關(guān)的不同臨床結(jié)果。DNA甲基化在該疾病中扮演著重要角色。兩項獨立研究表明,這一表觀遺傳標(biāo)記或有助于解釋不同JMML病人的結(jié)果差異。
德國癌癥研究中心的Christoph Plass、Daniel Lipka及同事分析了167例JMML樣本的DNA甲基化模式和突變情況,發(fā)現(xiàn)了三個甲基化水平各不一樣(高、中、低)的亞組。甲基化水平高的病人,臨床結(jié)果差;甲基化水平低的病人,預(yù)后良好;所有三組的突變情況都不一樣,表明在JMML病人中,DNA甲基化機制的激活與突變模式存在關(guān)聯(lián)。美國加州大學(xué)舊金山分校的Elliot Stieglitz、Mignon Loh及同事研究了39名病人的DNA甲基化,獨立鑒定出三個DNA甲基化亞組,其中高甲基化水平與不良臨床結(jié)果相關(guān),而低甲基化水平與良好預(yù)后相關(guān);他們在另外40名病人身上驗證了這一點。
鑒定JMML特異性的DNA甲基化異常模式。
Lipka et al.
該研究為根據(jù)DNA甲基化劃分不同JMML患者奠定了基礎(chǔ),有助于我們進一步了解JMML的基礎(chǔ)生物學(xué)機制。
NComms|doi: 10.1038/s41467-017-02178-9 NComms|doi: 10.1038/s41467-017-02177-w